权威的个人隐私亲子鉴定中心多以公立的医院为主，包括中国医科大学附属口腔医院、中山大学附属第一医院、中山医院、上海交通大学医学院附属新华医院、上海市第六人民医院等。此外，还有一些国学研究机构也开展个人隐私亲子鉴定工作，其中有总部位于西安的中国文学研究院，以及香港科技大学，以及香港大学生物医学中心等。
除了常规样本外，在个人隐私亲子鉴定中，一些难以检测出亲子关系的特殊样本也是经常被鉴定的，例如双胞胎、婴儿出生后收养的儿童、婴儿出生后被转移的婴儿以及单亲家庭中子女的父母关系等样本。为此，这些特殊样本有可能采取其它科学技术，如血缘关系检测等，以确定其个人隐私亲子关系。此外，对于亲子关系存在疑义但是样本损毁的情况，还可以采取分子遗传学技术以辅助确定其亲子关系。
权威的个人隐私亲子鉴定中心有很多，如中国中医科学院儿童医学中心、中国红十字国际救援促进会、上海市出生缺陷防治研究中心、湖南省出生缺陷防治技术指导中心、山东省生殖健康研究中心等。
特殊样本一般包括血液样本、脐带样本、胚胎样本、卵母细胞样本等。其中，血液样本常用于含抗原的膜蛋白的筛查及隐形小多聚体的检测；脐带样本常用于有可能记录遗传信息的细胞，例如存在DNA的癌症检测和抗原检测；胚胎样本常用于胚胎检测，如胚性染色体分析；卵母细胞样本由同一母体双多聚体筛查而收集，用于病毒、细菌和其它微生物的检测，例如易贝弗病毒、拉莫斯病毒。
在进行个人隐私亲子鉴定时，一些正规的司法鉴定机构通常具备专业资质和能力。比如各地经司法行政机关审核登记的司法鉴定机构，它们会遵循严格的鉴定流程和质量控制体系，以确保鉴定结果的准确性和可靠性。
个人隐私亲子鉴定的特殊样本有多种。常见的如牙刷，使用一段时间后的牙刷，上面会残留有口腔上皮细胞。还有指甲，剪下后用干净的纸包好即可。口香糖也可作为样本，咀嚼后的口香糖含有口腔细胞。此外，烟头也能用于鉴定，收集时注意避免污染。另外，经血、精斑等也属于特殊样本，但采集和保存有一定要求，需确保样本不受污染且能及时送检。需要强调的是，采集特殊样本时要注意方法正确、妥善保存，以保证后续鉴定的顺利进行。同时，选择进行亲子鉴定的机构一定要是正规合法、具备专业资质的，这样才能保障鉴定结果的权威性和公正性。
